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Banca de QUALIFICAÇÃO: EDILAINE DORIA ARAÚJO

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: EDILAINE DORIA ARAÚJO
DATA: 29/11/2022
HORA: 15:00
LOCAL: https://meet.google.com/xax-qszd-ypv
TÍTULO: Avaliação in silico do perfil de expressão gênica associado às diferentes lesões causadas pela infecção do papilomavírus humano para a identificação de potenciais biomarcadores
PALAVRAS-CHAVES: Câncer cervical, lesões cervicais, expressão gênica, NGS, HPV
PÁGINAS: 52
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Genética
SUBÁREA: Genética Molecular e de Microorganismos
RESUMO:

O câncer cervical é o segundo tipo mais comum nos países em desenvolvimento e o quarto mais comum em países desenvolvidos. As mulheres jovens possuem maior chance de sobrevida ao tratamento preventivo, quando a infecção já se encontra instalada. As infecções causadas por determinados tipos de papilomavírus humano, HPV, são as principais responsáveis pelo desenvolvimento de câncer cervical no Brasil e no mundo. Dessa forma, estabelecer um perfil transcriptômico utilizando sequenciamento de RNA contribui na compreensão das alterações citológicas e morfológicas até o surgimento do câncer do colo de útero. Este estudo visa fornecer informações para uma abordagem potencial terapêutica e seleção de novos biomarcadores, contribuindo para avaliação prognóstica de mulheres naturalmente infectadas por HPV. Logo, o objetivo do presente estudo é investigar o perfil de expressão gênica nas diferentes lesões e câncer cervical causado pelo HPV para a identificação de potenciais biomarcadores. Para isso, foram utilizadas sequências de RNA geradas por next-generation sequencing (NGS), oriundas da plataforma ilumina, de amostras cervicais, sem lesão, com lesão e câncer cervical causadas por HPV, disponíveis no Genome Expression Omnibus (GEO). As bibliotecas de RNAs dos projetos GSE147009 e GSE 149763 foram selecionados. A plataforma galaxy foi utilizada para transformar os arquivos de entrada FASTA ilumina em saída de arquivos FASTQ. A avaliação da qualidade desequências foi realizada utilizando o FASTQC e o corte da qualidade foi considerado o valor de Phred. Foram utilizadas as ferramentas Trimmomatic para remoção dos adaptadores e Tophat para alinhamento das reads com o genoma de referência humano. O total de genes expressos foi observado utilizando a ferramenta cufflinks. Para análise de expressão diferencial foi utilizada a ferramenta cuffdiff. O tamanho de cada biblioteca de RNA demonstrou em média reads pired-ends entre 155.244.590 e 34.511.420. A análise da qualidade das sequências demonstrou que todas as reads possuíam boa qualidade, tendo um valor de Phred médio de acima de 30. O alinhamento mostrou que 80,56% das sequências foram mapeadas com o genoma humano de referência (GRC38.p14 homo sapiens). A análise de expressão gênica identificou um total de 61.219 genes expressos (GSE147009) e 57.794 genes expressos (GSE149763) Um total de 1577 Differentially Expressed Genes (DEGs) foram observados. Em seguida, será avaliado o potencial da utilização do perfil de expressão destes genes como um biomarcador. Os estudos envolvendo o papel da expressão gênica para elucidar a progressão das diferentes manifestações clínicas se tornam relevantes para um melhor entendimento da progressão das lesões, auxiliando na avaliação do prognóstico da doença.Palavras-


MEMBROS DA BANCA:
Externo à Instituição - KIYOSHI FERREIRA FUKUTANI
Interno - 1897681 - LUCIANE MORENO STORTI DE MELO
Presidente - 2026761 - MARCUS VINICIUS DE ARAGAO BATISTA

Notícia cadastrada em: 18/11/2022 12:20
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