Banca de QUALIFICAÇÃO: ALEXANDRE SANTOS MATOS
04/02/2021 09:07
O Human papillomavirus (HPV) representa o agente infeccioso sexualmente transmissível maisprevalente em todo o mundo. O HPV penetra no epitélio através de microlesões e estabelece um focoinfeccioso que pode levar ao desenvolvimento do câncer cervical. Vacinas profiláticas contra o HPVestão disponíveis, no entanto não tem efeito em infecções já estabelecidas. O uso de ferramentas depredição in silico tem se mostrado como uma estratégia promissora na identificação e seleção de epítoposde células T candidatos de vacinas. Uma vantagem dessa estratégia é que os epítopos podem serselecionados de acordo com o grau de conservação dentro de um grupo de proteínas antigênicas, o quetorna possível alcançar uma ampla cobertura genotípica com um pequeno conjunto de epítopos. Dessemodo, o objetivo do presente estudo foi identificar e selecionar epítopos peptídicos conservados decélulas T derivados de proteínas do HPV. Para tanto, os epítopos foram preditos utilizando a ferramentaMHC-I Binding Predictions, um preditor baseado em afinidade. Após a predição inicial, aimunogenicidade dos epítopos foi avaliada. Parâmetros como grau de conservação, toxicidade, coberturapopulacional e estabilidade foram também considerados na seleção dos epítopos. 17 epítopos comafinidade a moléculas MHC classe I, abrangendo 5 supermotivos de ligação (A2, A3, A24, B62 e B57)foram selecionados. O conjunto de epítopos apresentou alta cobertura na população mundial. A análisede conservação mostrou que o grau de conservação encontrado foi consideravelmente alto entre diversosgenótipos do HPV. Sete epítopos apresentaram grau de conservação de 100% (NWKNFFSTTWE1594-603,KVSAFQYRVFRVL163-74, LQFIFQLCKL1372-380, RVFRVQLPDPNKL170-81, FNKPYWLHRL1307-315,FITCVDTTRL1330-338 e HLRREQIFARL1248-257) e quase todos ou outros apresentaram grau deconservação acima de 80%. Além disso, os peptídeos foram capazes de formar complexos estáveis commoléculas MHC classe I, o que pode ser observado pelos valores de meia-vida e treshold dentro dosparâmetros considerados pelo protocolo NetMHCstabpan. Uma análise de docking molecular confirmoua estabilidade dos complexos por meio de uma grande rede de pontes hidrogênio formada entre ospeptídeos e moléculas MHC e pela baixa energia de ligação calculada. Por fim, acredita-se que esseconjunto de epítopos possa ser utilizado como epítopos candidatos em estudos futuros como a construçãode proteínas quiméricas ou, ainda, serem expressos em vetores plasmidiais, como uma potencialestratégia para sensibilizar o braço CD8 da resposta imune mediada por células.
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