Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE: MATHEUS ISMERIM SILVA SANTOS
DATA: 07/02/2017
HORA: 09:00
LOCAL: Sala de video conferencia RENORBIO
TÍTULO: BIOPROSPECÇÃO DE MICRORGANISMOS COM POTENCIAL PARA DEGRADAÇÃO DE XENOBIÓTICOS E BIORREMEDIAÇÃO
PALAVRAS-CHAVES: xenobioticos, herbicidas, biorremediação, modelagem molecular.
PÁGINAS: 100
GRANDE ÁREA: Ciências Biológicas
ÁREA: Microbiologia
SUBÁREA: Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
ESPECIALIDADE: Bacterologia
RESUMO:

RESUMO:

A biorremediação utiliza processos microbiológicos com potencial para degradação de contaminantes xenobióticos e sua transformação em substâncias inertes. O volume de informações genéticas e bioquímicas disponíveis nos bancos de dados atualmente oferecem subsídios para a seleção de microrganismos e modelagem de enzimas envolvidas em vias de degradação de compostos poluentes. Tais condições estimularam a aplicação de ferramentas de bioinformática existentes para prospectar microrganismos de interesse biotecnológico que possam ser utilizados na biorremediação de áreas contaminadas com xenobióticos herbicidas. Foi realizado levantamento na literatura e no banco de dados KEGG PATHWAY Database para enzimas competentes para transformação do herbicida pendimetalina. As sequências homólogas de aminoácidos de citocromos P450 bacterianos foram obtidas na database do NCBI utilizando a ferramenta BLASTP a partir da sequencia query CYP1A1 humana (NP_000490.1). O alinhamento das seqüências de aminoácidos e análise filogenética pelo método Neighbor-Joining foram realizados utilizando aplicações do software MEGA. A modelagem estrutural da enzima de uma espécie de cada grupo filético foi realizada utilizando os programas: Modeller 9.12; SWISS-MODEL e Robbeta Server. Os modelos proteicos foram avaliados quanto a sua qualidade em relação aos parâmetros de TM-score, RMSD e valores de Ramachandran. Ensaios de acoplamento entre os compostos (ligantes) e as enzimas (receptores) foram realizadas in silico utilizando o programa PyRx - Virtual Screening Tool, implementando o algoritmo Vina 2.0. Espécies bacterianas candidatas isoladas de solo foram cultivadas com o herbicida como única fonte de carbono com sua degradação monitorada por GC-MS. Os modelos de CYP450 bacterianos apresentam qualidade (estabilidade energética) adequada para simulação de ligação. Os complexos ligante-receptor formados nos ensaios de docking molecular apresentam afinidade energética teórica (∆G) favorável para a interação similares ao controle experimental. Os isolados bacterianos dos gêneros Burkholderia e Methylobacterium confirmaram a predição computacional e realizaram degradação de até 80% do herbicida. Tais achados demonstram que os microrganismos prospectados possuem aplicabilidade para degradação do herbicida pendimetalina e seu potencial para biorremediação.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 2335200 - CHARLES DOS SANTOS ESTEVAM
Interno - 1690189 - EDILSON DIVINO DE ARAUJO
Interno - 2026761 - MARCUS VINICIUS DE ARAGAO BATISTA
Externo ao Programa - 3553547 - BRANCILENE SANTOS DE ARAUJO
Externo ao Programa - 1199629 - CARLA MARIA LINS DE VASCONCELOS
Externo ao Programa - 2225863 - MURILO MARCHIORO