O Curso de Medicina Veterinária foi criado pela Resolução 68/2009-CONEPE/UFS, iniciando atividades em 2010. Obteve nota 4 na Classificação do MEC. O curso é integral com oferta de 50 vagas/ano e duração mínima de 5 anos.

O Curso de Medicina Veterinária da UFS tem como perfil do formando egresso/profissional o Médico Veterinário com formação generalista, humanista, crítica e reflexiva, apto a compreender e traduzir as necessidades de indivíduos, grupos sociais e comunidades. Com relação às atividades inerentes ao exercício profissional, tem no âmbito de seus campos específicos de atuação em saúde animal e clínica veterinária; saneamento ambiental e medicina veterinária preventiva, saúde pública e inspeção e tecnologia de produtos de origem animal; zootecnia, produção e reprodução animal e ecologia e proteção ao meio ambiente. Tem conhecimento dos fatos sociais, culturais e políticos da economia e da administração agropecuária e agroindustrial; bem como dos conhecimentos essenciais de Medicina Veterinária, para identificação e resolução de problemas.

O Hospital Veterinário Universitário (HVU), inaugurado em 2015, possui estruturas modernas em uma área de 2.460 m². Além de referência em atendimento veterinário, o HVU funciona como hospital escola, sendo utilizado como espaço para práticas acadêmico-científicas.